بدايات الصراع في السودان تمتد إلى أكثر من قرن الزمن، فهي تعود إلى فترة السيطرة البريطانية على السودان والسياسات التي اعتمدتها والإجراءات التي اتخذتها التي استهدفت فيها فصل الجنوب عن الشمال.وبذلك تشكلت خصوصية للجنوب تطورت مع مرور الزمن إلى حالة من الخلافات والصراع الدائم مع الشمال والتي انتهت في العام ٢٠٠٥ إلى توقيع اتفاق السلام الشامل، الذي يفترض به وضع حداً للصراع بين الشمال والجنوب. مجموعة من الإجراءات منها إجراء استفتاء لتقرير مصير جنوب السودان والذي انتهى إلى انفصال جنوب.